美吉生物

基因表达调控 转录组 全转录组测序

全转录组测序 技术参数 留言咨询

随着RNA,特别是非编码RNA研究的不断深入,单一的转录组学测序已经不能满足现有的科研需求,为系统的揭示生物现象背后RNA世界的转录调控规律,全转录组应运而生。全转录组的研究不再局限于mRNA,同时涵盖了种类丰富,数量庞大的调控型非编码RNA分子(包括miRNA,lncRNAcircRNA等)。全转录组高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法和小片段富集筛选建库方法,可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程(例如生长发育、疾病发生等)的数据信息,全转录组学研究将调控机制研究延伸到网、多层面结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。


适用范围

  1)生理调控:动植物生长发育、新陈代谢研究

  2)外源胁迫:营养缺乏、抗逆、抗病虫害调控机理研究

  3)表型性状:动植物表型(肉质、花色)形成等研究

  4)药物效应:动物或人体疾病用药效果

  5)致病机理:疾病发生发展过程机制

  6)分子标记:疾病潜在潜在biomarker筛选,作为预后、治疗指导


美吉优势

  1)突破单一RNA类型限制,实现转录+调控的全方位研究

  2)数据丰富,一次实验,同时获得4RNA信息

  3)ncRNA靶基因预测,功能注释,多维度的关联分析

  4)紧扣前沿科研热点,构建ceRNA网络

  5)经验丰富,实验流程成熟,数据可靠

  6)采用云平台交付数据,多维度结果图片展示,数据图表循环挖掘


实验流程



生信分析





技术参数


样本要求

动物:≥1 g

植物:≥2 g

全血:≥ 2 mL

细胞: 5×106 cells

RNA要求

≥4 μg200 ng/μL

建库测序

longRNA-seq去核糖体,链特异性文库,Illumina PE150测序

smallRNA-seqSMART技术建库,Illumina SE75测序

数据量

mRNA+lncRNA+circRNA15G clean data

miRNA10M raw reads



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